בכיכר קדומים, הכיכר המרכזית של יפו העתיקה, שוכן מוזיאון ארכיאולוגי תת-קרקעי המוקדש להיסטוריה הארוכה של העיר. המוזיאון מציג ממצאים ארכיאולוגיים, ציורי אמנות ויצירות שונות, המגוללים את סיפורה של יפו לאורך 5,000 שנות קיומה.
בכניסה מוקרנת מצגת מרהיבה המספרת את תולדות העיר מראשיתה. בנוסף לתערוכות הקבועות, מתקיימות במקום תערוכות זמניות, הרצאות וסמינרים. המחקר הארכיאולוגי ממשיך להתקדם, ואוסף המוזיאון מתעדכן כל העת בממצאים חדשים ובעתיקות ייחודיות, המוסיפות ממד נוסף לעברה המרתק של יפו.
הסיור ביפו העתיקה מתחיל מהחניון הדרומי הגדול ומוביל דרך הנמל הציורי, שטומן בחובו את ההיסטוריה העשירה של העיר. משם ממשיכים בסמטאות הצרות של העיר העליונה עד לבית אילנה גור, מוזיאון מרתק המשלב אמנות, עיצוב והיסטוריה. הסיור ממשיך אל סדנתו של האמן פרנק מייסלר, שם ניתן להתרשם מפסליו הייחודיים. בדרך חולפים על פני "התפוז המרחף" – אחת האטרקציות המסתוריות של יפו, ומגיעים לפארק אברשה, המשקיף על תל אביב ונוף הים התיכון. משם ממשיכים לכיכר המזלות, שטומנת בחובה אווירה קסומה ומסתורית, ולכנסיית סנט פטרוס המרשימה. לאחר מכן, יורדים חזרה לנמל, שם ניתן ליהנות מאווירת הים והסירות, לפני שחוזרים לחניון וחותמים את הסיור בחוויה בלתי נשכחת.