שעות הביקור הן מ־9:00 בבוקר ועד 16:00, עם הארכה עד 17:00 בקיץ (התקופה שבין פסח לסוכות). עין מבוע הוא המעיין האמצעי מבין שלושת מעיינות נחל פרת. מי המעיין ממלאים בריכה מלאכותית שנבנתה בידי הבריטים בשנת 1936, כחלק ממערכת אספקת המים לירושלים.
טיול יום יפה במדבר יהודה מתחיל במנזר אותימיוס הגדול. משם נרד אל מקור המים של עין מבוע בנחל פרת, בנקודה הצופה אל נופי ואדי קלט. בהמשך נבקר במוזיאון השומרוני הטוב, עם אוסף פסיפסים מרשים במיוחד, נרד במדרגות אל מנזר סנט ג׳ורג׳ התלוי מעל אפיק הנחל, ונסיים בנבי מוסא – המקום שבו, על פי המסורת המוסלמית, נקבר משה.