ליד הכניסה למתחם מעיינות המים של עין מבוע מתחיל מסלול ההליכה המסומן באדום. זהו מסלול רשמי המוביל אל בריכת השחייה ואל מנזר חריטון, המקום שבו החל דרכו אבטימיוס. אתרים אלו הם חלק מהפארק הלאומי, והכניסה אליהם כרוכה בתשלום.
טיול יום יפה במדבר יהודה מתחיל במנזר אותימיוס הגדול. משם נרד אל מקור המים של עין מבוע בנחל פרת, בנקודה הצופה אל נופי ואדי קלט. בהמשך נבקר במוזיאון השומרוני הטוב, עם אוסף פסיפסים מרשים במיוחד, נרד במדרגות אל מנזר סנט ג׳ורג׳ התלוי מעל אפיק הנחל, ונסיים בנבי מוסא – המקום שבו, על פי המסורת המוסלמית, נקבר משה.