המוזיאון מוקדש כולו לתולדות הספנות באגן הים התיכון, בים סוף ועל גדות הנילוס. תצוגות המוזיאון משקפות 5,000 שנות היסטוריה ימית. תצוגת הקבע מחולקת למדורים המציינים את הקשר של האדם לים במרוצת השנים: ארכיאולוגיה תת ימית, אמנות ימית, מיתולוגיה ימית, הים התיכון, נמליו ואייו, ספנות חדשה, קרבות ים, בנייה ימית. נוסף על כך תוכלו ליהנות מאוסף מרשים של דגמי אניות; מממצאי הארכיאולוגיה התת ימית כגון כלי חרס, מטבעות וחותמות; ומאוסף גדול של מפות עתיקות ותחריטים. תערוכות של אמנים ישראליים ובינלאומיים בנושאי ים מוצגות במשך השנה.